程序性细胞死亡蛋白1 (PD-1)和程序性死亡配体1 (PD-L1)是被证实的癌症靶点，然而，受体相互作用调控的细胞内信号传导对癌症进程的影响和机制尚不清楚。2023年6月，科罗拉多大学的Antonio Jimeno团队在“Journal of the National Cancer Institute（IF：10.3,1区）”杂志上发表题为“The programmed death ligand 1 interactome demonstrates bidirectional signaling coordinating immune suppression and cancer progression in head and neck squamous cell carcinoma”的研究，首次利用邻近标记技术联合LC/MS质谱分析高通量筛选并鉴定了在是否外源补充重组PD-1蛋白（rPD-1）的情况下与PD-L1互作的蛋白，以阐明PD1抑制剂诱导肿瘤免疫逃避的深层机制[1]。

PD-1和PD-L1抑制剂广泛应用于人类癌症。研究表明，在T细胞上表达的PD-1与肿瘤细胞表达的结合，可驱动肿瘤免疫逃逸，抑制PD-1可延长复发和/或转移性头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者的生存期。但从临床疗效看，抗PD-1和抗PD-L1的有效率仅为17%和13%，因此，探究何种机制促使的癌细胞对PD-L1抑制更加易感将促进更有效的治疗手段的开发，这对于对免疫治疗不敏感或出现免疫耐药的患者尤为重要。作者的工作证实PD-1和PD-L1之间的相互作用会导致HNSCC细胞表现出更高的癌细胞克隆特性、运动性和侵袭性，以及对放疗和化疗的耐受性。

为进一步探究细胞内PD-L1与蛋白伙伴的相互作用如何受PD-1的影响，作者召开了基于BioID2的邻近标记试验，即在是否外源补充重组PD-1蛋白（rPD-1）的情况下，分别转染PD-L1-BioID2融合表达质粒至HNSCC细胞中，之后顺利获得外源生物素加入，生物素化与PD-L1互作的近端内源蛋白质，再利用链霉亲和素磁珠进行pull down，将被生物素标记的蛋白富集下来，并顺利获得液相色谱-质谱(LC-MS) 平台，鉴定与 PD-L1结合的近端蛋白。结果显示，与PD-L1相互作用的57个蛋白中，有10个蛋白在有无rPD-1存在的情况下均与PD-L1互作，但在rPD-1作用下丰度增加，其中包括白细胞介素增强子结合因子2和3 (ILF2和ILF3)。机制上，PD-L1可顺利获得直接与ILF2/ILF3互作诱导的ILF2和ILF3的核易位，促进STAT3通路活化。在rPD-1存在的情况下该作用明显增强，可导致更高的癌细胞克隆特性、运动性和侵袭性，以及对放疗和化疗的耐受性。

总之，在本研究中，作者利用BioID2介导的邻近标记联合LC-MS技术成功揭示了PD-L1在HNSCC 细胞中的相互作用网络，该研究有助于科研人员进一步分析PD-1/PD-L1相互作用诱导肿瘤免疫逃避的深层机制，以及其对抑制癌症进展的意义，为提高PD1靶向治疗的易感性给予参考。

蛋白质邻近标记技术允许与靶蛋白融合表达的标记酶在融合蛋白的附近空间区域，标记短暂、持续靶标蛋白附近的猎物蛋白分子，使之将已知的反应基团如生物素，共价连接到附近的蛋白质上，从而利用反应基团的纯化方式捕捉猎物蛋白。相较于本研究所用的BioID2的邻近标记技术，TurboID 具有更高的活性，生物素标记时间从原有的18h缩短至10min，从而实现更高的时间分辨率和更广泛的体内应用[2]。可广泛应用于蛋白-蛋白相互作用、筛选功能蛋白互作景观、弱相互作用或瞬时相互作用的筛选、揭示病原入侵、复制及免疫逃逸机理。

其次，本文中利用互作组学技术探究了三者之间的相互作用，有不少伙伴还没有太分析互作组学的概念和意义，可以查阅前期文章《三篇1区SCI机制——k8com官网小朱教你将抽象分子机制社会化》http://www.tjwxys.com/News/163939.html

总结互作组学的公式，即A对B和C复合物互作的影响，比如在本文中，A是干预因素PD-1，存在或不存在PD-1的情况下，B和C的互作状态是如何受其影响的。这是一种允许k8com官网利用AP-MS技术或临近标记-MS技术高通量筛选C角色研究思路，这种研究思路的优势在于，解释了机体在受到刺激，或者经受干预因素处理时，为k8com官网给予生理层面，蛋白-蛋白，蛋白-RNA，蛋白-DNA大分子之间相互作用动态的景观。

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